Os sintomas mais comuns da intolerância a lactose são náusea, dores abdominais, diarréia ácida e abundante, tremores, mal estar, gases e desconforto.
Os sintomas dependem da quantidade ingerida e da quantidade de lactose que cada pessoa pode tolerar.
Em alguns casos pode ocorrer somente dor e distensão abdominal, sem diarréia. Os sintomas podem levar de alguns minutos até muitas horas para aparecer. O movimento muscular que empurra o alimento ao longo do estômago pode influenciar o tempo para o aparecimento dos sintomas.
Os sintomas não são perigosos, mas são bastante desconfortáveis. Estes sintomas ocorrem devido a lactose não digerida continuar dentro do intestino grosso, onde é fermentada por bactérias produzindo ácido láctico e gases. A presença de lactose e destes compostos nas fezes no intestino grosso aumenta a retenção de água no intestino causando diarréia ácida e gasosa, flatulência cólicas e aumento do volume abdominal.